1998年，我部与美方签署《关于在华实施美国志愿者项目协议》，由美方派遣友好志愿者来华从事英语教学工作。

　　2000年3月，陈至立部长与美国教育部部长赖利分别代表两国政府签署了《中华人民共和国政府和美利坚合众国政府教育交流合作协定》。

　　2002年10月，周济副部长与美国教育部长佩奇签署了《中美关于网络语言教学的合作谅解备忘录》。

　　2003年5月至6月，教育部副部长章新胜赴美访问。在此期间，为推动中美教育高层建立固定的磋商、对话机制，促进民间教育交流的持续发展，章副部长访问了美国教育部及有关大学和教育机构。 

2003年9月，教育部副部长赵沁平率团赴美、加访问了美国部分高校和科研机构，以及美国校企合作等情况。 

　　2004年7月，教育部章新胜副部长率团赴美出席了全美州教育委员会（ECS）年会、全美州基础教育首席官员理事会（CCSSO）暑期研讨班和美国亚洲协会专门召集的招待会。章部长在三个场合上分别发表了主旨演讲。 

　　2004年8月，教育部吴启迪副部长率团赴美访问。在美期间，参加了有28名中国著名高校领导参加的“耶鲁-中国大学领导高级研讨班”开幕式活动，并访问了耶鲁大学、哈佛大学、麻省理工学院、卡内基梅隆大学、匹兹堡大学、斯坦福大学等著名学府和NASA等科研机构。 

　　2005年7月，教育部副部长陈小娅访问美国，出席了中美第三次基础教育论坛、美国州教育委员会年会、美国州长协会年会并顺访纽约市教育局、旧金山和犹他州教育厅、杨伯翰大学和纽约市的中小学。通过这次访问，中美正式开始了政府间在中小学科学（物理、化学、生物）和数学领域的教育交流与合作。 

　　2005年8月，教育部章新胜副部长赴美出席我部与耶鲁大学合作举办的第二届“耶鲁－中国大学领导高级研讨班”的部分活动，并顺访哈佛大学、丹佛大学，与美国国务院、教育部进行了会谈，就续签《中美教育交流协定》和促进美方恢复中美网络语言教学项目做了卓有成效的工作。 

　　2005年11月，教育部吴启迪副部长访美，考察了德克萨斯州和加利福尼亚州的公立高等教育系统，尤其是其医学教育体制，并慰问了美国南部地区遭受飓风灾害的中国留学人员代表。